Секретаріат НСЖУ – виконавчий робочий орган.

Секретарів НСЖУ обирає правління. До складу секретаріату можуть бути обрані як члени правління, так і інші активісти НСЖУ, керівники (президенти, голови тощо) всеукраїнських творчих об’єднань працівників засобів масової інформації, у діяльності яких НСЖУ бере участь.
Засідання секретаріату проводяться в разі потреби, скликаються головою НСЖУ. Засідання правомочне, якщо на ньому присутня більш як половина його складу. Рішення ухвалюється простою більшістю голосів присутніх або (та) шляхом візування проектів документів більшістю складу секретаріату.

Секретаріат НСЖУ:

• обговорює і вносить на розгляд правління НСЖУ цільові програми;
• ухвалює рішення щодо проведення організаційно-творчих заходів НСЖУ;
• затверджує щорічні програми міжнародної діяльності, з наступним затвердженням правлінням;
• затверджує кошториси ревізійної комісії НСЖУ та інших витрат з наступним затвердженням правлінням;
• визначає переможців творчих конкурсів та присуджує премії, представляє членів НСЖУ до відзначення державними нагородами, почесними званнями, державними преміями, іншими видами морального та матеріального заохочення;
• за поданням голови формує апарат НСЖУ;
• затверджує статути регіональних організацій НСЖУ, заснованих НСЖУ редакцій, видавництв, підприємств, створених установ та організацій, що реєструються у встановленому чинним законодавством порядку, ухвалює у разі необхідності рішення про їхню ліквідацію з наступним затвердженням правлінням;
• приймає на роботу та звільняє директора Журналістського фонду, керівників створених установ і організацій та заснованих підприємств, які працюють за контрактами, визначає та затверджує їхні обов’язки;
• веде поточну роботу.

Список секретарів Національної спілки журналістів України

(станом на 01.03.2018):

• Ліна Кущ, перший секретар НСЖУ;​ 
• Олександр Бриж, головний редактор газети «Донбасс», колишній голова Донецької обласної організації НСЖУ;
• ​ Віктор Весілик, власкор телеканалу «Рада» в Одесі;
• ​ Гліб Головченко, директор миколаївського Коледжу преси і телебачення, генеральний продюсер телеканалу «ТАК TV»;
• ​ Віталій Голубєв, головний редактор видавничого дому «ОГО» (Рівне), викладач Національного університету «Острозька академія»;
• ​ Костянтин Григоренко, головний редактор газети «Обрії Ізюмщини» (Харківська область), керівник робочої групи НСЖУ з питань роздержавлення преси;
• ​Денис Іванеско, директор інформаційного агентства «Українські новини»;​ 
• ​ Ольга Куліш, директор філії ПАТ «НСТУ» «Волинська регіональна дирекція»;
• ​ Степан Курпіль, видавець газети «Високий Замок» (Львів);
• ​ Валерій Макеєв, правозахисник, журналіст (Черкаси), автор біографічної книжки «100 днів полону»;
• ​ Олег Наливайко, голова Державного комітету телебачення і радіомовлення України;
• ​ Світлана Остапа, заступник шеф-редактора ГО «Детектор медіа», член наглядової ради ПАТ «НСТУ»;
• ​ Вікторія Плахта, відповідальний секретар (у минулому – голова) Івано-Франківської обласної організації НСЖУ;
• ​ Сергій Сай-Боднар, керівник прес-центру УНІА «Укрінформ»;
• ​ Зоя Шарікова, член правління Київської регіональної організації НСЖУ, голова ревізійної комісії КЖЕ;
• ​ Сергій Шевченко, член правління Київської регіональної організації НСЖУ;
• ​ Олена Юрченко, редактор проекту Крим.Реалії, переселенка з Криму.